MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-QVLC chromosome

Total Repeats: 7321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018676	TAC	2	6	30	35	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681355
2	NC_018676	GT	3	6	42	47	0 %	50 %	50 %	0 %	407681355
3	NC_018676	TAC	2	6	102	107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681355
4	NC_018676	TGA	2	6	129	134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681355
5	NC_018676	ATG	2	6	233	238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681355
6	NC_018676	A	8	8	360	367	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
7	NC_018676	A	7	7	370	376	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
8	NC_018676	CAG	2	6	377	382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407681355
9	NC_018676	ATT	2	6	386	391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681355
10	NC_018676	A	6	6	398	403	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
11	NC_018676	TAA	2	6	416	421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681355
12	NC_018676	CTA	2	6	458	463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681355
13	NC_018676	TAAT	2	8	503	510	50 %	50 %	0 %	0 %	407681355
14	NC_018676	GCT	3	9	520	528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407681355
15	NC_018676	A	7	7	562	568	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
16	NC_018676	GGT	2	6	586	591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407681355
17	NC_018676	AT	3	6	602	607	50 %	50 %	0 %	0 %	407681355
18	NC_018676	T	6	6	675	680	0 %	100 %	0 %	0 %	407681355
19	NC_018676	AGG	2	6	681	686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407681355
20	NC_018676	AGA	2	6	687	692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
21	NC_018676	TAA	2	6	707	712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681355
22	NC_018676	TA	3	6	715	720	50 %	50 %	0 %	0 %	407681355
23	NC_018676	AGC	2	6	792	797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407681355
24	NC_018676	CAA	2	6	829	834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681355
25	NC_018676	TA	3	6	853	858	50 %	50 %	0 %	0 %	407681355
26	NC_018676	CTG	2	6	860	865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407681355
27	NC_018676	TAA	2	6	935	940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681355
28	NC_018676	A	6	6	961	966	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
29	NC_018676	ACT	2	6	988	993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681355
30	NC_018676	GAT	2	6	1003	1008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681355
31	NC_018676	ATA	2	6	1009	1014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681355
32	NC_018676	GGT	2	6	1021	1026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407681355
33	NC_018676	A	8	8	1049	1056	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
34	NC_018676	T	6	6	1066	1071	0 %	100 %	0 %	0 %	407681355
35	NC_018676	AAG	2	6	1076	1081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
36	NC_018676	AGG	2	6	1134	1139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407681355
37	NC_018676	GGT	2	6	1213	1218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407681355
38	NC_018676	A	7	7	1238	1244	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
39	NC_018676	TAC	2	6	1245	1250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681355
40	NC_018676	CTA	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681355
41	NC_018676	A	7	7	1261	1267	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
42	NC_018676	T	6	6	1274	1279	0 %	100 %	0 %	0 %	407681355
43	NC_018676	CAG	2	6	1283	1288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407681355
44	NC_018676	GAAA	2	8	1330	1337	75 %	0 %	25 %	0 %	407681355
45	NC_018676	A	7	7	1335	1341	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
46	NC_018676	AAAT	2	8	1350	1357	75 %	25 %	0 %	0 %	407681355
47	NC_018676	TTTGA	2	10	1369	1378	20 %	60 %	20 %	0 %	407681355
48	NC_018676	CTC	2	6	1394	1399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407681355
49	NC_018676	TAA	2	6	1496	1501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681355
50	NC_018676	GGT	2	6	1513	1518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407681355
51	NC_018676	AGA	2	6	1524	1529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
52	NC_018676	AAAT	2	8	1532	1539	75 %	25 %	0 %	0 %	407681355
53	NC_018676	GAT	2	6	1542	1547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681355
54	NC_018676	AGA	3	9	1569	1577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
55	NC_018676	A	6	6	1579	1584	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
56	NC_018676	GAA	2	6	1588	1593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
57	NC_018676	A	6	6	1659	1664	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
58	NC_018676	A	7	7	1673	1679	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
59	NC_018676	TAAT	2	8	1694	1701	50 %	50 %	0 %	0 %	407681355
60	NC_018676	TGA	2	6	1725	1730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681355
61	NC_018676	AGA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
62	NC_018676	TAA	2	6	1755	1760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681355
63	NC_018676	GAA	2	6	1768	1773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
64	NC_018676	AT	3	6	1783	1788	50 %	50 %	0 %	0 %	407681355
65	NC_018676	A	6	6	1790	1795	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
66	NC_018676	A	8	8	1805	1812	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
67	NC_018676	A	7	7	1841	1847	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
68	NC_018676	TCT	2	6	1858	1863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407681355
69	NC_018676	A	6	6	1867	1872	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
70	NC_018676	TGT	2	6	1881	1886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407681355
71	NC_018676	GAA	2	6	1900	1905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
72	NC_018676	TAA	3	9	1908	1916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681355
73	NC_018676	ATT	2	6	1955	1960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681356
74	NC_018676	TAA	2	6	1977	1982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681356
75	NC_018676	CTG	2	6	1985	1990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407681356
76	NC_018676	A	7	7	2004	2010	100 %	0 %	0 %	0 %	407681356
77	NC_018676	ATC	2	6	2036	2041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681356
78	NC_018676	TC	3	6	2109	2114	0 %	50 %	0 %	50 %	407681356
79	NC_018676	A	6	6	2123	2128	100 %	0 %	0 %	0 %	407681356
80	NC_018676	CA	3	6	2173	2178	50 %	0 %	0 %	50 %	407681356
81	NC_018676	AAT	2	6	2179	2184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681356
82	NC_018676	TAA	2	6	2241	2246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681356
83	NC_018676	CAA	4	12	2247	2258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681356
84	NC_018676	T	8	8	2457	2464	0 %	100 %	0 %	0 %	407681356
85	NC_018676	ACA	2	6	2469	2474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681356
86	NC_018676	TGC	2	6	2751	2756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407681356
87	NC_018676	AGG	2	6	2760	2765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407681356
88	NC_018676	TAAAGG	2	12	2850	2861	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407681356
89	NC_018676	GTA	2	6	2876	2881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681356
90	NC_018676	ATT	2	6	2952	2957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681356
91	NC_018676	TTA	2	6	4341	4346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
92	NC_018676	ATAA	2	8	4385	4392	75 %	25 %	0 %	0 %	407681357
93	NC_018676	AGATAA	2	12	4393	4404	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407681357
94	NC_018676	ATA	2	6	4411	4416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
95	NC_018676	GTT	2	6	4443	4448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407681357
96	NC_018676	T	6	6	4447	4452	0 %	100 %	0 %	0 %	407681357
97	NC_018676	AT	3	6	4463	4468	50 %	50 %	0 %	0 %	407681357
98	NC_018676	ATT	2	6	4478	4483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
99	NC_018676	ATA	3	9	4489	4497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
100	NC_018676	CCTATA	2	12	4514	4525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681357
101	NC_018676	AT	3	6	4569	4574	50 %	50 %	0 %	0 %	407681357
102	NC_018676	CTG	2	6	4593	4598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407681357
103	NC_018676	AAC	2	6	4622	4627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681357
104	NC_018676	ATT	2	6	4696	4701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
105	NC_018676	GTT	2	6	4733	4738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407681357
106	NC_018676	TAA	2	6	4750	4755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
107	NC_018676	TGCATT	2	12	4793	4804	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407681357
108	NC_018676	ATT	2	6	4808	4813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
109	NC_018676	GTAA	2	8	4817	4824	50 %	25 %	25 %	0 %	407681357
110	NC_018676	ATT	2	6	4870	4875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
111	NC_018676	AGTA	2	8	4927	4934	50 %	25 %	25 %	0 %	407681357
112	NC_018676	ATT	2	6	4936	4941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
113	NC_018676	A	6	6	4943	4948	100 %	0 %	0 %	0 %	407681357
114	NC_018676	TAT	2	6	5131	5136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
115	NC_018676	AGT	2	6	5146	5151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681357
116	NC_018676	ATC	2	6	5155	5160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681357
117	NC_018676	ATA	2	6	5170	5175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
118	NC_018676	ATA	2	6	5197	5202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
119	NC_018676	ATA	2	6	5208	5213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
120	NC_018676	A	6	6	5231	5236	100 %	0 %	0 %	0 %	407681357
121	NC_018676	AGA	2	6	5248	5253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681357
122	NC_018676	AT	3	6	5261	5266	50 %	50 %	0 %	0 %	407681357
123	NC_018676	TAAA	2	8	5314	5321	75 %	25 %	0 %	0 %	407681357
124	NC_018676	TTA	2	6	5322	5327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
125	NC_018676	AAAG	2	8	5365	5372	75 %	0 %	25 %	0 %	407681357
126	NC_018676	TAA	2	6	5395	5400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
127	NC_018676	ATT	2	6	5423	5428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
128	NC_018676	CTT	2	6	5439	5444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407681357
129	NC_018676	TTTA	2	8	5449	5456	25 %	75 %	0 %	0 %	407681357
130	NC_018676	A	6	6	5469	5474	100 %	0 %	0 %	0 %	407681357
131	NC_018676	ATTAAA	2	12	5495	5506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
132	NC_018676	AAT	2	6	5523	5528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
133	NC_018676	TATC	2	8	5529	5536	25 %	50 %	0 %	25 %	407681357
134	NC_018676	ATT	2	6	5537	5542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
135	NC_018676	ATAAA	2	10	5548	5557	80 %	20 %	0 %	0 %	407681357
136	NC_018676	ATA	2	6	5580	5585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
137	NC_018676	TAA	2	6	5593	5598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
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